효소에 기질이 결합하는 것에 대한 두 가지 모델 효소에 기질이 결합하는 것에 대한 두 가지 모델 효소-촉매반응에서 효소는 반응물의 하나인 기질(substrate)에 결합하여 복합체를 형성합니다. 복합체의 형성은 전이상태의 형성으로 이어지고 이어서 생성물이 생성됩니다. 효소반응에서 전이상태의 본질은 그 자체가 큰 연구 분야입니다. 기질은 대개 활성 부위라 불리는 효소의 작은 부위에 비공유 결합으로 결합합니다. 효소의 활성 부위는 종종 단백질 내의 틈이나 오목한 곳에 자리 잡고 있으며, 효소 활성에 필수적인 특정 아미노산으로 구성되어 있습니다. 촉매반응은 활성 부위에서 대개 몇 단계를 거쳐 일어납니다. 자물쇠-열쇠 모델(lock-and-dey model) 기질의 모양과 효소 결합 부위의 기하학적 형태가 매우 유사하다고 가정합니다. 기질은 자신과 상보적인 .. 2020. 9. 4. 칼럼 크로마토그래피 크로마토그래피(chromatography) '색'을 뜻하는 그리스어 chroma와 '기록하다'라는 의미의 graphein에서 유래된 단어입니다. 쉽게 눈에 보이는 색깔을 가진 식물 색소를 분리하는 데에 처음 사용되었습니다. 무색의 화합물을 분리하는 것도 그 화합물을 검출할 수 있는 방법이 있는 한 가능하므로 오랫동안 사용되어 왔습니다. 크로마토그래피는 화합물들이 상이한 두 가지 상 간에 분포할 때나 물질의 분리 가능한 부위들 사이에 분포할 때 그 분포된 정도가 화합물들끼리 서로 다르다는 사실에 근거하고 있습니다. 한 가지 상은 고정상(stationary phase)이고 다른 상은 이동상(mobile phase)입니다. 이동상은 고정상을 이루고 있는 물질 위로 흐르는데, 분리될 시료는 이 이동상을 따라 운.. 2020. 9. 4. 단백질 정제 및 특성 단백질 정제 및 특성 순수한 단백질을 세포에서 어떻게 추출하는가? 단일 세포 내에서는 서로 다른 수많은 단백질들이 존재합니다. 어느 단백질이라도 그 한 단백질의 성질을 자세히 연구하려면 한 종류의 분자만으로 구성된 균일한 시료가 있어야 합니다. 단백질의 분리와 정제는 그다음 실험을 위한 필수적인 첫 단계입니다. 일반적으로, 분리 기술은 분자들 간에 차이가 나는 크기, 전하, 극성 등에 초점을 맞추고 있습니다. 오염물질들을 제거하고 대상 단백질의 순수한 시료를 얻기 위해서 여러 가지 기술이 수행된다. 정제 단계들을 거쳐가면서, 정제가 어느 정도 잘 되었는지를 측정하기 위해 단백질의 순도와 회수된 양을 나타내는 표를 만듭니다. 세포에서 단백질의 분리 실제 정제 과정을 시작하기 전에 단백질을 세포와 세포 소기.. 2020. 9. 3. 아미노산들의 구조와 성질 아미노산들의 구조와 성질 제1군-곁사슬이 비극성인 아미노산 비극성 곁사슬이 있는 아미노산군이다. 여기에는 알라닌(alanine), 발린(valine), 류신(leucine), 아이소류신(isoleucine), 프롤린(proline), 페닐알라닌(phenylalanine), 트립토판(tryptophan), 메티오닌(methionine)이 있습니다. 이 군의 아미노산들 중 알라닌, 발린, 류신과 아이소류신은 각각의 곁사슬이 지방족 탄화수소 작용기입니다. 프롤린은 질소가 두 탄소 원자에 결합되어 있는 지방족 고리 구조입니다. 유기화학 용어를 사용하면 프롤린의 아미노기는 2차 아민이므로 프롤린은 종종 이미노산이라고 부리기도 합니다. 반면에 다른 일반 아미노산은 모두 1차 아민입니다. 제2군-곁사슬이 전기적으로 .. 2020. 9. 3. 아미노산과 펩타이드 아미노산과 펩타이드 단백질은 아미노산이 펩타이드 결합으로 연결되어 있는 긴 사슬이며, 한쪽 끝에는 질소를 포함한 양전하를 띤 아미노기가, 다른 쪽 끝에는 음전하를 띤 카복실기가 있습니다. 사슬을 따라 일련의 서로 다른 곁사슬들이 있는데, 이 곁사슬은 각각의 20가지 아미노산들이 모두 다릅니다. 아미노산이 2개가 연결되어 있으면, 다이펩타이드이고, 3개가 연결되어 있으면 트라이펩타이드 입니다. 가장 중요한 것이 아미노산의 서열입니다. 글라이신-라이신-알라닌과 알라닌-라이신-글라이신은 다른 펩타이드이며, 화학적 의미도 다릅니다. 길이가 아미노산 20개 정도 되는 사슬에 대해서는 가능한 서열이 1억 가지 이상이 됩니다. 아미노산은 무엇이며 아미노산의 3차원 구조는 어떠한가? 단백질에서는 20가지 아미노산들이 .. 2020. 9. 3. 이전 1 ··· 3 4 5 6 7 다음
