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카이모트립신의 작용 메커니즘 카이모트립신의 작용 메커니즘 중요한 아미노산 잔기인 195번 세린과 57번 히스티딘은 촉매작용 메커니즘에 관여되어 있습니다. 유기화학 용어를 사용하면, 세린 곁사슬의 산소는 핵을 추구하는 물질로 친핵체라 합니다. 친핵체는 양전하나 극성 물질의 양전하 부위(전자가 부족한 부위)에 결합하려는 경향이 있는 반면, 친전자체는 전자를 추구하는 물질이며 음전하 또는 극성 물질의 음전하 부위에 결합하려는 경향이 있습니다. 카이모트립신의 세린에 있는 친핵성 산소는 기질의 펩타이드 작용기에 있는 카보닐 탄소를 공격합니다. 이제 탄소는 4개의 단일 결합을 가지고 되어 사면체형 중간체가 형성됩니다. 원래의 -C=O 결합은 단일 결합으로 되고 카보닐 산소는 산소음이온으로 됩니다. 사면체형 중간체에서 아실-효소 중간체가 형성됩.. 2020. 9. 8.
자이모젠이란 무엇인가 자이모젠이란 무엇인가 자이모젠 알로스테릭 상호작용은 4차 구조의 가역적 변화를 통해 단백질의 작용 양상을 조절합니다. 이 메커니즘은 효율적일지는 몰라도 유일한 조절방법은 아닙니다. 자이모젠은 효소의 불활성형 전구체입니다. 공유결합의 절단에 의해 비가역적으로 활성형 효소로 전환될 수 있습니다. 단백질분해효소인 트립신과 카이모트립신은 자이모젠과 그 활성화에 대한 고전적인 예로 제시됩니다. 이들의 불활성 전구체 분자인 트립시노젠과 카이모트립시노젠은 각각 췌장에서 생성되는데, 만약 이것들이 췌장에서 활성형 상태의 효소로 만들어진다면 췌장이 손상을 입을 것입니다. 이 효소들의 소화 특성을 필요로 하는 소장에서는 특정한 펩타이드결합이 절단됨으로써 이 효소들이 활성화됩니다. 카이모트립시노젠이 카이모트립신으로 전환되는.. 2020. 9. 8.
알로스테릭 효소에 영향을 주는 조절 메커니즘 알로스테릭 효소에 영향을 주는 조절 메커니즘 피드백 저해 작용 RNA와 DNA를 만드는 데에 필요한 뉴클레오사이드 3인산인 사이티딘 3인산(CTP)을 최종적으로 만드어내는 일련의 반응에서의 첫번째 단계를 ATCase가 촉매합니다. 뉴클레오타이드를 생산하는 경로는 에너지가 소모되는 과정이며 여러 단계가 관여되어 있습니다. 아스파트산 카바모일전이효소에 의해 촉매 되는 반응은 이런 화합물이 과다하게 생산되지 않도록 이 경로가 어떻게 조절되는지를 보여주는 좋은 예입니다. RNA와 DNA 합성의 경우, 여러 뉴클레오사이드 3인산의 농도가 조절됩니다. CTP는 이 경로의 첫 번째 반응을 촉매 하는 효소인 ATCase의 저해제입니다. 이러한 작용 양상은 피드백 저해 작용의 한 예인데, 이 저해 작용은 연속 반응의 최.. 2020. 9. 8.
효소에 기질이 결합하는 것에 대한 두 가지 모델 효소에 기질이 결합하는 것에 대한 두 가지 모델 효소-촉매반응에서 효소는 반응물의 하나인 기질(substrate)에 결합하여 복합체를 형성합니다. 복합체의 형성은 전이상태의 형성으로 이어지고 이어서 생성물이 생성됩니다. 효소반응에서 전이상태의 본질은 그 자체가 큰 연구 분야입니다. 기질은 대개 활성 부위라 불리는 효소의 작은 부위에 비공유 결합으로 결합합니다. 효소의 활성 부위는 종종 단백질 내의 틈이나 오목한 곳에 자리 잡고 있으며, 효소 활성에 필수적인 특정 아미노산으로 구성되어 있습니다. 촉매반응은 활성 부위에서 대개 몇 단계를 거쳐 일어납니다. 자물쇠-열쇠 모델(lock-and-dey model) 기질의 모양과 효소 결합 부위의 기하학적 형태가 매우 유사하다고 가정합니다. 기질은 자신과 상보적인 .. 2020. 9. 4.
칼럼 크로마토그래피 크로마토그래피(chromatography) '색'을 뜻하는 그리스어 chroma와 '기록하다'라는 의미의 graphein에서 유래된 단어입니다. 쉽게 눈에 보이는 색깔을 가진 식물 색소를 분리하는 데에 처음 사용되었습니다. 무색의 화합물을 분리하는 것도 그 화합물을 검출할 수 있는 방법이 있는 한 가능하므로 오랫동안 사용되어 왔습니다. 크로마토그래피는 화합물들이 상이한 두 가지 상 간에 분포할 때나 물질의 분리 가능한 부위들 사이에 분포할 때 그 분포된 정도가 화합물들끼리 서로 다르다는 사실에 근거하고 있습니다. 한 가지 상은 고정상(stationary phase)이고 다른 상은 이동상(mobile phase)입니다. 이동상은 고정상을 이루고 있는 물질 위로 흐르는데, 분리될 시료는 이 이동상을 따라 운.. 2020. 9. 4.

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